Биореактор, он же биологический фильтр, представляет из себя цилиндрическую емкость из полипропилена (бочка). После механической очистки, очищенная вода подаётся в приемную часть биореактора (на верх). Далее вода попадает в распределительную воронку, где поток разбивается и равномерно распределяется, попадая в отсек с биологической загрузкой. Отсек с биозагрузкой в емкости биореактора отделён специальными перфорированными перегородками, через которые проходит оборотная вода. В этом отсеке происходят процессы денитрификации воды.
В качестве субстрата для культивации гетеротрофных бактерий в биореакторе используется специальная тонущая биозагрузка из термопластичного полимер этилена марки PE-04 виде цилиндрических элементов с множеством пластинок, лучей и перегородок, диаметром 16 мм и толщиной 10 мм, имеющая отрицательную плавучесть и полезную площадь поверхности 850 м2/м3. Био-загрузка постоянно омывается нисходящим потоком воды и восходящим потоком сжатого воздуха, который подается в фильтр специальным компрессором (воздуходувкой). Вода, загрязненная растворенными в ней азотными метаболитами (аммиак и аммоний) и другими органическими соединениями в растворенном виде проходя через биореактор, очищается биологическим методом и подается на дальнейшие степени очистки и затем в бассейны с рыбой.